DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Yersinia pestis'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3SGL_A_SAMA692 3sgl SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Yersinia pestis TRNA
5-METHYLAMINOMETHYL-
2-THIOURIDINE
BIOSYNTHESIS
BIFUNCTIONAL PROTEIN
MNMC
PF01266
(Methyltransf_30)
PF05430
(DAO)
14 GLU A  64
GLY A  66
GLY A  68
THR A  69
LEU A  71
ASN A  72
GLU A 101
LYS A 102
TYR A 103
ASP A 156
VAL A 157
ASP A 178
GLY A 179
PHE A 180
SAM A 692
3TZF_B_08DB280 3tzf 08D

DB01015
(Sulfamethoxazole)
Yersinia pestis 7,8-DIHYDROPTEROATE
SYNTHASE
no annotation 8 PHE B  28
THR B  62
ARG B  63
PRO B  64
GLY B 189
PHE B 190
LYS B 221
SER B 222
08D B 280
4QI9_A_MTXA201 4qi9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   6
ALA A   8
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
TYR A 101
THR A 114
MTX A 201
4QI9_B_MTXB201 4qi9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   6
ALA B   8
ASP B  28
LEU B  29
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
ARG B  53
LEU B  55
ARG B  58
TYR B 101
THR B 114
MTX B 201
4QI9_C_MTXC201 4qi9 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 11 ILE C   6
ALA C   8
ASP C  28
LYS C  33
SER C  50
ILE C  51
ARG C  53
LEU C  55
ARG C  58
TYR C 101
THR C 114
MTX C 201
5BPH_A_ACTA403 5bph ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Yersinia pestis D-ALANINE--D-ALANINE
LIGASE
PF01820
(Dala_Dala_lig_N)
PF07478
(Dala_Dala_lig_C)
6 TYR A 210
LYS A 215
ARG A 255
GLY A 276
SER A 281
LEU A 282
ACT A 403
5BPH_B_ACTB403 5bph ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Yersinia pestis D-ALANINE--D-ALANINE
LIGASE
None 5 LYS B 215
TYR B 216
ARG B 255
ASN B 272
GLY B 276
ACT B 403
5BPH_B_ACTB404 5bph ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Yersinia pestis D-ALANINE--D-ALANINE
LIGASE
None 7 TYR B 210
LYS B 215
TYR B 216
ARG B 255
GLY B 276
SER B 281
LEU B 282
ACT B 404
5BPH_C_ACTC403 5bph ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Yersinia pestis D-ALANINE--D-ALANINE
LIGASE
None 4 TYR C 210
GLY C 276
SER C 281
LEU C 282
ACT C 403
5BPH_D_ACTD403 5bph ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Yersinia pestis D-ALANINE--D-ALANINE
LIGASE
None 6 TYR D 210
LYS D 215
ARG D 255
GLY D 276
SER D 281
LEU D 282
ACT D 403
5BPH_D_ACTD406 5bph ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Yersinia pestis D-ALANINE--D-ALANINE
LIGASE
None 4 LYS D 215
ARG D 255
ASN D 272
GLY D 276
ACT D 406
5HI6_A_MTXA201 5hi6 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
PF00186
(DHFR_1)
12 ILE A   6
ALA A   8
ASP A  28
LEU A  29
LYS A  33
SER A  50
ILE A  51
ARG A  53
LEU A  55
ARG A  58
TYR A 101
THR A 114
MTX A 201
5HI6_B_MTXB201 5hi6 MTX

DB00563
(Methotrexate)
Yersinia pestis DIHYDROFOLATE
REDUCTASE
no annotation 12 ILE B   6
ALA B   8
ASP B  28
LEU B  29
LYS B  33
SER B  50
ILE B  51
ARG B  53
LEU B  55
ARG B  58
TYR B 101
THR B 114
MTX B 201